La MAPS est née de la convergence des intérêts de chercheuses et chercheurs en sciences humaines et sociales à l'Université de Neuchâtel, et de leur volonté de renforcer les échanges entre leurs disciplines. Les recherches entreprises dans le cadre de la MAPS s'articulent autour de trois thématiques :

• La circulation des personnes
• La circulation des richesses
• La circulation des connaissances

La MAPS se veut aussi une courroie de transmission entre le savoir développé par les sciences sociales et la vie culturelle, politique et sociale de la région. Sa volonté de dialogue et son esprit critique se matérialisent dans les projets et les activités menées au nom de "la fabrique de demain" - des sciences sociales publiques qui s'impliquent dans la transformation de la société.