Les cinq instituts de la  Faculté des sciences économiques couvrent plusieurs domaines d'activité et de recherche. En plus de leur mission de formation, les professeurs et chercheurs participent activement à des programmes de recherche tant sur le plan national (Fonds national suisse de la recherche scientifique) qu'international (programmes européens). Plusieurs d'entre eux réalisent régulièrement des mandats pour les entreprises et les collectivités publiques, ainsi que pour les organisations internationales telles que l'OCDE, le Conseil de l'Europe, la Banque mondiale… Ces expériences et savoir-faire en matière de recherche et d'expertise enrichissent les divers enseignements dispensés au sein de la Faculté des sciences économiques.