Auréline Bouchard

Introduction

Je suis actuellement dans ma 2ᵉ année de doctorat dans le domaine de la microbiologie. Je m’intéresse particulièrement aux interactions entre bactéries et champignons.

Je travaille actuellement sur plusieurs projets en parallèle, chacun visant à approfondir nos connaissances fondamentales sur les interactions entre microorganismes et leur rôle dans le fonctionnement des écosystèmes.

Dans un premier projet, j’étudie le microbiome des morilles, c’est-à-dire l’ensemble des microorganismes qui vivent en association avec ces champignons. Je m’intéresse plus particulièrement à une bactérie appelée Pseudomonas koreensis, qui pourrait contribuer à protéger les morilles contre certains prédateurs. Pour comprendre son rôle, j’utilise différentes approches expérimentales, allant de la microbiologie classique à la génomique, en passant par l’étude des interactions entre bactéries, champignons et insectes.

Mes travaux portent également sur une question plus générale : comment décrire et mesurer les interactions entre bactéries et champignons de manière objective et comparable ? Aujourd’hui, ces interactions sont souvent décrites qualitativement, mais il reste difficile de les comparer entre différents systèmes biologiques. Nous cherchons donc à développer de nouvelles méthodes permettant de les caractériser à l’aide de paramètres mesurables.

Dans ce contexte, je m’intéresse notamment à l’activité électrique des microorganismes. Tout comme les cellules animales ou végétales, les bactéries et les champignons produisent et utilisent des signaux électriques. Nous explorons l’idée que ces signaux pourraient constituer une nouvelle façon de détecter, quantifier et mieux comprendre les interactions entre microorganismes.

À terme, l’objectif est de mieux comprendre les principes généraux qui gouvernent les interactions bactéries-champignons et de développer des outils permettant de les étudier dans des contextes très variés.