Former Collaborators
Former Post-Doc researchers
- 2019-2025 – Dr. Guillaume Lentendu
- 2023-2025 – Dr. Quentin Blandenier
- 2022-2024 – Dr. Clément Duckert
- 2022-2023 – Dr. David Singer
- 20XX-20XX – Dr. Thierry Heger
Dr. David SINGER
PhD student (2012-2017)
Post-Doc researcher (2022-2023)
Dr. Clément DUCKERT
PhD student (2016-2022)
Post-Doc researcher (2022-2024)
Dr. Quentin BLANDENIER
PhD student (2016-2020)
Post-Doc researcher (2023-2025)
Dr. Guillaume LENTENDU
Post-Doc researcher (2019-2025)
Former PhD students
- 2025 – Elizaveta Ermolaeva
- 2024 – Dr. Estelle Bruni
- 2022 – Dr. Julie Hernandez
- 2022 – Dr. Clément Duckert
- 2020 – Dr. Quentin Blandenier
- 2018 – Dr. Nicolas Derungs
- 2017 – Dr. Ildikò Szelecz
- 2017 – Dr. Isabelle Koenig
- 2017 – Dr. Christophe Seppey
- 2017 – Dr. David Singer
- 2016 – Dr. Leonardo Fernández
- 2016 – Dr. Valeria Trivellone
- 2016 – Dr. Matthieu Mulot
- 2014 – Dr. Anush Kosakyan
- 2014 – Dr. Joël Amossé
- 2014 – Dr. Emanuela Samaritani
- 2013 – Dr. Bertrand Fournier
- 2012 – Dr. Fatma Gomaa
- 2011 – Dr. Andy Siegenthaler
- 2010 – Dr. Thierry Heger
Dr. Julie HERNANDEZ
PhD student (2018-2022)
Scientific collaborator and project manager – CEDD-Agro-Eco-Clim
Dr. Estelle BRUNI
PhD student (2019-2024)
Elizaveta ERMOLAEVA
PhD student (2021-2025)
Former collaborators
- Isacco Darini – Scientific collaborator and creator and manager of the lab database
- Dr. Hongai Li – Visiting scientist from Jilin Normal University, China
- Paolo DeVita – Visiting scientist from Universitario de Rabanales, University of Cordoba, Spain
- Dr. Yangmin Qin – Visiting PhD student from Key Laboratory of Biogeology and Environmental Geology of Ministry of Education, China University of Geosciences, Wuhan, China
- Monika Reczuga – Visiting PhD student from the University Adam-Mickiewicz of Poznań
- Dr. Daniele Corsaro – Scientific collaborator
- Dr. Sonia-Estelle Tarnawski – Scientific collaborator
- Dr. Marion Quartier – Scientific collaborator
- Elodie Kuhnert – Scientific collaborator
- Kathleen Hasler – Scientific collaborator
- Lauren Kroll – Scientific collaborator
- Nina Feddern – Scientific collaborator
- Vincent Robert – Scientific collaborator
- Daniela Weber – PhD student (collaboration CABI)
- Alan Simonin – Civiliste
- Camille Bugnon – Scientific collaborator
- Mirko d’Inverno – Scientific collaborator
- Dr. Petr Hedenec – Post-Doc researcher
- Dr. Enrique Lara – MER and scientific collaborator
Isacco DARINI
Scientific collaborator
Creator and manager of the lab database
Former MSc students
- 2025 – Lucie Rinquet
- Integration of hydrogeologically relevant variables in the potential distribution model of Hyalosphenia papillo
- 2025 – Lucile Lamy
- Développement d’un outil de reconnaissance auto-matique des thécamibes des tourbières pour application en restauration, gestion et paléoécologie des tourbières
- 2025 – Melvin Chavanne
- La biodiversité cachée des communautés d’Arachnides dans les milieux karstiques suisses
- 2025 – Emilie Favre
- Analyse comparative des communautés de collemboles sur les nunataks des Alpes valaisannes
- 2025 – Caroline Planche
- Étude paléoécologique d’une tourbière en Islande
- 2024 – Roxane Gualino
- Étude comparative de la diversité des amibes à thèque et des protistes du sol le long de trois gradients d’altitude de litière de Calluna vulgaris dans les Alpes et les Açores
- 2023 – Marie Horvath
- Changes in the soil fauna and functional properties in a former wooded pasture in Central Valais
- 2023 – Camile Vögeli
- Carbone cycling in peatlands: building a transfer function based on testate amoebae to infer methane and carbon dioxide fluxes
- 2023 – Benjamin Ory
- Establishing a morphometric and molecular protocol to study the diversity of Hyalospheniidae in Switzerland
- 2023 – Anouchka Leubaz
- Prospection and evaluation of parasite levels in whitefish and Artic charr in Lake Geneva
- 2022 – Robin Calisti
- Impact of climate change and effect of renaturation methods on peatlands in the Jura mountains
- 2022 – Anne-Mai Do
- PestiField – Une étude sur l’impact d’un biopesticide et d’un pesticide de synthèse sur les communautés microbiennes du sol d’un vignoble expérimental de La Côte
- 2021 – Joris Weber
- Biodiversité et distribution des amibes à thèque du sol le long de gradients d’altitude dans les Alpes suisses, en Europe et au Japon
- 2021 – Clément Chessex
- Impact des préparations biodynamiques 500 et 501 sur les communautés fongiques des sols de vigne
- 2021 – Anais Bonetti
- Can the climate and micro-environmental conditions of peat bogs be inferred from the morphometry of a single testate amoeba species?
- 2021 – Alicia Fresard
- Relationships between northern peatland testate amoebae and methane emissions – building a transfer function for inferring present and past methane emissions for peatland monitoring
- 2019 – Sofia Pereira Dos Santos
- Impacts d’un biopesticide et d’un pesticide de synthèse sur les communautés microbiennes du sol: cas d’étude en mésocosmes
- 2019 – Jérémy Boillat
- Evaluation de la toxicité de la carbendazime, de l’imidaclopride et du thiaclopride sur Euglypha rotunda (Rhizaria : Euglyphida), une espèce commune d’amibe du sol
- 2019 – Edouard Cattin
- Diversity of Cercomonadida in a forest soil and impact of decomposing pig cadaver
- 2017 – Loïc Bulliard
- L’impact du type de gestion culturale sur les communautés de mésofaune, de vers de terre et sur les propriétés physico-chimiques du sol dans des vergers de Suisse romande
- 2017 – Florence Schwendener
- Response of testate amoebae and vegetation to changes of water table depth in a restored Sphagnum peatland
- 2017 – Anthony Dénervaud
- Influences présentes et passées de l’hydrogéomorphologie sur l’écologie des marais et des sites marécageux de Suisse
- 2017 – Arnaud Vallat
- Cartographie des conditions écologiques de la tourbière de la Gruère par l’analyse des communautés d’amibes à thèques actuelles et subfossiles
- 2016 – Clément Duckert
- Morphological and molecular taxonomy of Euglypha – Towards a calibration of the molecular clock
- 2016 – Nathalie Amacker
- Development of a method to test soil protists in ecotoxicology and its application to an herbicide
- 2016 – Gilda Dell’Ambrogio
- Impact des néonicotinoïdes sur le collembole Folsomia fimetaria dans les sols agricoles
- 2016 – Damien Zappa
- Impact des changements climatiques récents sur les hauts-maraisde Suisse : une approche paléoécologique par l’analyse des communautés des thécamoebiens et de la composition de la tourbe le long d’un gradient altitudinal
- 2015 – Quentin Blandenier
- Design and evaluation of a new mitochondrial marker for Arcellinida (Amoebozoa)
- 2015 – Lara Grandgirard
- Impact of atmospheric pollutants on Testate Amoeba species of European peat bogs – A contribution to the international project PEATBOG: A cross-European survey
- 2013 – Vanessa Farine
- Typologie et cartographie des sols du futur parc naturel périurbain dans la région de Neuchâtel. Etude indirecte du régime hydrique.
- 2013 – Guy Rochat
- Etude des communautés de nématodes dans les sols urbains et leur rôle en tant qu’indicateur environnemental potentiel
- 2013 – Christophe Seppey
- Euglyphid communities under a pig (Sus scrofa) cadaver assessed by high-throughput sequencing: A new Post Mortem Interval bioindicator?
- 2012 – Thierry Arnet
- Etude de marais favorables et défavorables à la réintroduction de Saxifraga hirculus.
- 2012 – Isabelle Koenig
- Les amibes à thèques comme bioindicateurs : étude de quatre tourbières selon un gradient altitudinal dans les Préalpes bernoises, comparaison des gradients de végétation et des communautés d’amibes à thèques entre Rhynchosporion et Sphagnion magellanici.
- 2012 – Natalie Lemonis
- Etude paléoécologique d’une tourbière de l’Oural russe.
- 2012 – François Schindeholz
- 2012 – Christelle Schneider
- Développement des communautés d’organismes du sol et fonctions associées dans un milieu perturbé en régénération (Tourbière du Marais Rouge, vallée des Ponts-de-Martel)
- 2012 – Christophe Wildi
- Etude des effets du climat sur le DOC, certains substrats particuliers de la méthanogenèse, et les fluxs de méthane, dans quatre tourbières situées le long d’un gradient altitudinal.
- 2011 – Claire Meugnier
- Arbuscular mycorrhizal fungi and subordinate plant species: preferential symbiotic interactions?
- 2009 – Tierry Perruchoud
- Mise au point et réalisation de tests écotoxicologiques sur Euglypha rotunda
Caroline PLANCHE
MSc student
Melvin CHAVANNE
MSc student
Lucile LAMY
MSc student
Former MSc students from other institutions
Work done at University of Neuchâtel with mentoring by lab members
- 2023 – Alisa Shakurova (Université de Bourgogne Franche-Comté, France; Advisor: Pr. Renaud Scheifler, co-advisors: E. Mitchell & G. Lentendu)
- Analysis of microbial community diversity in a Sphagnum peatland of the Jura mountains and its correlation with CO2 and CH4 flux measurements
- 2013-2014 – Franziska Sorge (Johann Wolfgang Goethe – Universität Frankfurt am Main, Germany; Advisor: Dr. Jens Amendt, co-advisor: E. Mitchell)
- Effect of cadavers on soil nematode communities – developing a new indicator for post-mortem interval
- 2009-2010 – Ildikò Szelecz (Johann Wolfgang Goethe – Universität Frankfurt am Main, Germany; Advisor: Dr. Jens Amendt, co-advisor: E. Mitchell)
- Soil organisms beneath a cadaver- a tool for estimating the time of death
Former lab technicians
- Thibaud Goetschi