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Isha Hashmi

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Post-doctorante
 

Bureau A221

Tel: +41 32 718 22 56

 

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Mes domaines d'intérêt sont l'écologie microbienne et la microbiologie appliquée. Actuellement, je travaille sur trois sujets principaux:

1)    Bioremédiation: La contamination des sols due à la dispersion des déchets industriels et urbains est l’une des principales préoccupations environnementales. Dans le cadre de ce projet, l’un de mes objectifs est d’explorer et d’exploiter les fructifications de champignons pour la bio-récupération de métaux précieux présents dans les déchets urbains, principalement des boues d’épuration digérées.

2)    Agriculture durable: Dans l'agriculture conventionnelle, les pratiques de gestion et l'utilisation de produits agrochimiques inappropriés ont eu des impacts majeurs sur les sols et sur l'eau. Pour ces raisons, la recherche d'alternatives durables en agriculture est devenue une priorité. Gardant ces points à l'esprit, je travaille au développement d'un nouveau bio-fongicide contre les agents pathogènes fongiques transmis par le sol qui affectent les cultures dans le monde entier. Dans le cadre de ce projet, je suis également intéressé à comprendre l’effet du bio-fongicide appliqué sur les communautés microbiennes indigènes et sa persistance dans le sol. Ce projet est une collaboration avec l'Agroscope et la Haute Ecole Arc HE-Arc (BE-JU-NE).

3)    Les interactions bactéries-champignons et champignons-champignons: dans les écosystèmes terrestres, les bactéries et les champignons interagissent non seulement avec les plantes, mais également entre eux, ce qui peut avoir un impact significatif sur la croissance des plantes. Les deux type d'organismes sont connus pour leurs capacités nutritionnelles diversifiées, menant à des interactions positives, neutres et négatives. La mycophagie est un type d'interaction antagoniste dans lequel une bactérie peut obtenir des nutriments à partir de champignons vivants, produisant un impact négatif sur le partenaire fongique. La mycophagie est bien étudiée dans le genre Collimonas, mais on sait peu de chose dans le genre Lysinibacillus. Dans ce projet, j'étudie et et je cherche à comprendre les mécanismes impliqués dans la mycophagie différentielle de Lysinibacillus sphaericus vis-à-vis de champignons ayant deux écologies différentes.

 

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Formations

Post-Doctorat , juin 2019 - présent, Laboratoire de Microbiologie, Université de Neuchâtel

Thèse de doctorat en Biologie, Oct 2014-Mai 2019, Laboratoire de Microbiologie, Université de Neuchâtel

Titre: Améliorer la bio-inoculation pour une agriculture durable

 
Récompenses et réalisations

Bourse de voyage du programme doctoral interuniversitaire en biologie des organismes, Neuchâtel, Suisse.

Bourse d'excellence du gouvernement suisse pour les chercheurs doctorant étrangers


Publications

  • Hashmi I, Bindschedler S & Junier P (in press). The Phylum Firmicutes, Volume I: Bacteria. In Amaresan N, Senthil Kumar M, Annapurna K, Kumar k & Sankaranarayanan A (Eds.) Beneficial Microbes in Agro-Ecology. Academic Press

 

  • Hashmi I, Paul C, Al-Dourobi A, Sandoz F, Deschamps P, Junier T, Junier P & Bindschedler S (2019) Comparison of the plant growth-promotion performance of a consortium of Bacilli inoculated as endospores or as vegetative cells. FEMS Microbiology Ecology 95.

 

  • Paul C, Filippidou S, Jamil I, et al. (2019) Chapter Three - Bacterial spores, from ecology to biotechnology. Advances in Applied Microbiology, Vol. 106 (Gadd GM & Sariaslani S, eds.), 79-111. Academic Press.

 

  • Firdaus e B, Shafiq M & Jamil S (2012) Role of plant growth regulators and a saprobic fungus in enhancement of metal phytoextraction potential and stress alleviation in pearl millet. Journal of Hazardous Materials 237-238: 186-193.

 

Expérience d'enseignements

Mai 2019: Assistant aux travaux pratiques de biorestauration, Laboratoire de microbiologie, Université de Neuchâtel.

Décembre 2017: Assistant de travaux pratiques en écologie moléculaire, Laboratoire de microbiologie de l'Université de Neuchâtel.

Mars-Avril 2017: Assistant pour l'apprentissage par problèmes en microbiologie, Laboratoire de microbiologie, Université de Neuchâtel. Sujet: Lutte biologique contre les champignons phytopathogènes à l'aide de bactéries mycophages

Octobre 2016: Assistant de travaux pratiques en écologie moléculaire, Laboratoire de microbiologie de l'Université de Neuchâtel.

Fev-Mars 2016: Assistant pour l'apprentissage par problèmes en microbiologie, Laboratoire de microbiologie, Université de Neuchâtel. Sujet: Utilisation de bactéries PGPR et de champignons saprophytes en tant que contrôle biologique d'agents phytopathogènes

Feb-March 2015: Assistant pour l'apprentissage par problèmes en microbiologie, Laboratoire de microbiologie, Université de Neuchâtel. Sujet: Influence de Trichoderma sur l'interaction entre bactéries et champignons phytopathogènes.

 

Conférences

Présentations orales

7e réunion suisse sur l'écologie microbienne (SME), Lausanne, Suisse, 2019

Sujet: Effet d'un consortium mixte de trois souches de Bacillus sur la promotion de la croissance de l'avoine par les plantes et ses conséquences sur les communautés microbiennes indigènes.
 

Réunion annuelle des doctorants - Propriété intellectuelle: du monde académique à l'industrie, Neuchâtel, 2018

Sujet: Mode de vie mycophage ciblé de Lysinibacillus sphaericus contre le champignon phytopathogène Rhizoctonia solani.

 

17ème symposium international sur l'écologie microbienne, Leipzig, Allemagne, 2018 (Courte présentation orale d'un poster)

Sujet: Mode de vie mycophage ciblé de Lysinibacillus sphaericus contre le champignon phytopathogène Rhizoctonia solani.

 

Congrès annuel de la Société suisse de microbiologie (SSM) Lausanne, Suisse, 2018

Sujet: Mode de vie mycophage ciblé de Lysinibacillus sphaericus contre le champignon phytopathogène Rhizoctonia solani.

 

Symposium sur la mycologie de Zurich 2018, Agroscope Reckenholz, Suisse, 2018

Sujet: Mode de vie mycophage ciblé de Lysinibacillus sphaericus contre le champignon phytopathogène Rhizoctonia solani.

 

Réunion annuelle des étudiants de doctorat 2015 - Nouvelles Techniques en Sciences, Neuchâtel, Suisse (Courte présentation orale d'un poster)

Sujet: Criblage des activités favorisant la croissance des plantes chez les bactéries formant des endospores et évaluation de leur association tripartite avec les champignons et les plantes du sol.


 


Poster
 

17ème symposium international sur l'écologie microbienne, Leipzig, Allemagne, 2018

Sujet: Mode de vie mycophage ciblé de Lysinibacillus sphaericus contre le champignon phytopathogène Rhizoctonia solani.

 

Réunion de Biologie 18, Neuchâtel, 2018

Sujet: Mode de vie mycophage ciblé de Lysinibacillus sphaericus contre le champignon phytopathogène Rhizoctonia solani.

 

Symposium international sur la production de cultures assistée par microbes (miCROPe), Vienne, 2017

Sujet: Bio-inoculation de consortiums pour promouvoir la croissance de bactéries, une stratégie prometteuse vers une agriculture durable.

 

7ème Congrès des microbiologistes européens (FEMS), Espagne, 2017

Sujet: Mode de vie mycophage de Lysinibacillus sphaericus contre un champignon phytopathogène Rhizoctonia solani

 

74ème réunion annuelle de la Société suisse de microbiologie, Berne, Suisse, 2016

Sujet: Bio-inoculation de consortiums pour promouvoir la croissance de bactéries, une stratégie prometteuse vers une agriculture durable.

 

Atelier MiCroP, Danemark, 2016

Sujet: Criblage des activités favorisant la croissance des plantes chez les bactéries formant des endospores

6e réunion suisse sur l'écologie microbienne, Ascona, Suisse, 2015

Sujet: Criblage des activités favorisant la croissance des plantes chez les bactéries formant des endospores

Réunion annuelle des étudiants de doctorat 2015 - Nouvelles Techniques en Science, Neuchâtel, Suisse

Sujet: Criblage des activités favorisant la croissance des plantes chez les bactéries formant des endospores et évaluation de leur association tripartite avec les champignons et les plantes du sol.