Das SZKF geniesst die Unterstützung mehrerer wichtiger Partner:

Das Bundesamt für Umwelt (BAFU), namentlich dessen Abteilung Artenmanagement, anerkannte info fauna - SZKF 1990 als nationales Datenzentrum für die Fauna. Seitdem deckt das Bundesamt das gesamte Betriebsbudget. Die entstandenen Beziehungen sind sehr eng, zum Beispiel auf der Ebene des Informationsaustauschs oder bei der Planung und Begleitung grösserer Projekte.

Die Stadt Neuenburg ist seit 1985 Mitglied der Stiftung SZKF. Über ihre Kulturabteilung Section des Affaires culturelles verpflichtete sich die Stadt offiziell, die Aktivitäten der Stiftung langfristig zu unterstützen. Die Unterstützung zeigt sich besonders in der engen Zusammenarbeit mit dem Naturhistorischen Museum Neuenburg, welches sich an der nationalen Strategie der Erhebung der Naturhistorischen Sammlungen beteiligt, welche info fauna initiiert hat. 

Die Universität Neuenburg ist ebenfalls Mitglied der Stiftung info fauna CSCF und unterstützt unsere Aktivitäten seit 1985 über ihre Informatikabteilung Service informatique et télématique (SITEL). Von Beginn weg beherbergte SITEL die Datenbank des SZKF und leistete für deren Betrieb und Weiterentwicklung logistische, wissenschaftliche und technische Hilfe. Die guten Beziehungen zwischen der Stiftung und der Universität Neuenburg mündeten 2001 in einer Vereinbarung und einem Leistungsvertrag, die beide vom Rektor der Universität sowie den Geschäftsleitern von SITEL und SZKF unterzeichnet wurden und sich durch den Einzugder Stiftung in die Räumlichkeiten der wissenschaftlichen Fakultät im 2018 ausdrückt. 

Die Organisation Pro Natura Schweiz trug aktiv zum Entstehen der Stiftung SZKF bei, indem sie beim Entwurf der Statuten und Ziele mitwirkte und danach mithalf, verschiedene wichtige Projekte zu lancieren (z.B. Atlas der Libellen und Tagfalter der Schweiz, 1985-1987). Seit damals leistet Pro Natura immer wieder finanzielle Unterstützung für Projekte von info fauna - SZKF, die mit den Zielen der Organisation übereinstimmen.