Les milieux humides représentent des biotopes importants pour quelques espèces de reptiles. Il s’agit essentiellement d’espèces dépendant plus ou moins des milieux aquatiques, comme la couleuvre à collier, la couleuvre vipérine et la couleuvre tessellée, ou encore la cistude d’Europe. Toutefois, on observe régulièrement d’autres espèces dans ces milieux ou en bordure, comme le lézard vivipare, le lézard agile ou l’orvet fragile.

La vipère péliade constitue un cas particulier, dans la mesure où on la rencontre localement dans les hauts-marais.