Vorder- und Hinterpfote des Fischotters sind ungleich gross. Der Vorderpfotenabdruck ist 4-7 cm lang und rundlich. Hinterpfotenabdruck ist 7-9 cm lang und länglich. Bei der Hinterpfote zeichnet sich oft auch die Sohle ab. Typisch ist die 5. Zehe, die wie bei allen Marderartigen gut sichtbar ist. Die Zehen sind mit Schwimmhäuten verbunden. Diese bilden sich jedoch meist nur in weichem, lehmigen Untergrund ab. Ebenfalls haben Fischotter Krallen, die sie nicht einziehen können. Sie bilden sich deutlich ab und sind recht breit an der Basis. 

Fussunterseiten von Vorderfuss (vl) und Hinterfuss (hl) und die daraus resultierenden Trittsiegel.
(Illustration U. Iff). 

Trittsiegel (links) aus einer Spur (rechts) auf lehmigem Untergrund. 

Trittsiegel (links) aus einer Spur (rechts) auf sandigem Untergrund.