La conservation d’une collection de référence à partir du matériel récolté est indispensable pour les personnes qui déterminent des individus au niveau espèce. La collection devrait être vérifiée par des spécialistes. Elle permet de lever toute incertitude en cas de détermination incertaine et témoigne de la qualité des relevés effectués.

Les collections déposées dans un Musée doivent remplir certaines exigences. Les « directives pour l’archivage du Macrozoobenthos » fournissent toutes les informations utiles à la conservation des invertébrés aquatiques. Il est conseillé de les appliquer aussi pour sa propre collection.