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Corrélation de l’analyse moléculaire des gènes de la région ITS et d’une partie du gène de la b-tubuline avec le cycle biologique et la résistance envers Trichoderma sp, chez Grifola frondosa.

Introduction

Le Grifola frondosa présente un intérêt économique au niveau mondial, il est largement cultivé pour ses qualités gustatives et médicinales dans plusieurs régions du monde. Le développement de nouvelles souches et son industrialisation pour la Suisse a été développée dans notre laboratoire. La sélection de nouveaux individus et de substrats a impliqué cependant de long et coûteux processus d’essais.
Tout dernièrement le développement des techniques de biologie moléculaire a commencé à être utiliser pour une sélection beaucoup plus rapide de souches fongiques hautement productrices et/ou résistantes aux mycoparasites.

But de notre travail

Avec 7 souches d’origine géographique différente ( Japon, USA, CH et B) nous allons effectuer l’analyse moléculaire des gènes de la régions ITS et du gène partielle de la b-tubuline , afin de démontrer l’existence d’une corrélation entre le dendrogramme obtenu pour l’espèce et :

• sa capacité à fructifier sur différents substrats et la qualité de sa fructification.
• la résistance des souches vis à vis de Trichoderma sp.
• sa capacité de dégradation des composants lignocellulosiques.

Caractéristiques que nous analysons en parallèle par des techniques culturelles classiques.

Les différentes étapes de notre travail

Pour les expériences sur

1. La fructification :
   • analyse des variables trophiques sur la fructification.
2. La résistance à Trichoderma sp :
   • analyse des mécanismes de défense directs ou indirects (production d’antimycotique).
3. La confrontation :
   • analyse de la compatibilité somatique.
4. La dégradation :
   • mesure de la biomasse cellulaire formée en calculant la
     quantité de N-Acétylglucosamine dans x grammes de sciure et
     celle dans un pellet séché.
   • mesure du pourcentage de lignine et d’holocellulose restant.

·Pour l’analyse moléculaire

• Extraction de l’ADN
• Amplification par PCR de la région ITS et d’une partie du gène de la b-tubuline
• Clonage des fragments
• Séquençage des fragments
• Construction du dendrogramme.

last update : 27.08.2003