Dernières modifications le 29 janvier 2008. Prière de m'informer (jean-marc.neuhaus(at)unine.ch) si un lien n'est plus valable.
Sur cette page:
Biochimie générale |
Liens plus spécialisés pour étudiants avancés et collaborateurs:
Banques de séquences et outils de biologie moléculaire |
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l'Université de Neuchâtel |
Chimie analytique (Prof. Ward, Institut de Chimie)avec des définitions importantes, par ex. stoechiométrie, acides-bases, etc. |
Biochimie (Prof. Neuhaus): |
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De l'univers aux particules élémentaires: les puissances de 10EnzymologieSur Interactive biochemistry , vous pouvez essayer différentes valeurs de KM, Vmax sur les graphes de Michaelis-Menten, Lineweaver-Burke et Hanes-Woolf, ainsi que l'effet de différents KI et [I] d'inhibiteurs compétitifs et non-compétitifs Cyberlipid Center avec pages sur les différents lipides naturels |
Un livre de Biologie Online fourni par le Estrella Mountain Community College: Chapitre sur l'eau et les molécules organiques, (attention! il est indiqué sur ce site que l'eau liquide serait constituée de molécules d'eau sans ponts H: en fait sous cette forme l'eau est gazeuse!une molécule d'eau liquide forme en moyenne 3,9 ponts H, alors que dans la glace elle en forme 4) Accès à quelques livres complets online, en particulier Biochemistry (Berg, Tymoczko et Stryer, 2002), The Cell (Cooper, Geoffrey, 2000), Molecular Biology of the Cell (Alberts et al., 2002), Molecular Cell Biology (Lodish et al., 1999) |
Schéma de la glycolyse, cycle de Krebs (R.Huskey, Virginia |
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Voies métaboliques:The Main Metabolic Pathways on Internet |
Chaîne respiratoireLa chaîne respiratoire couple un transport d'électrons par des complexes membranaires au pompage de protons de la matrice vers l'espace intermembranaire des mitochondries. Quand ce gradient de protons est utilisé pour la synthèse d'ATP, on parle de phosphorylation oxidative
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L'ATP synthase ou ATPase pompe à protonsC'est une turbine qui couple le passage des protons à travers la membrane à la rotation d'un élément mobile (rotor) par rapport au reste immobile (stator) de la protéine. Cette rotation permet la synthèse de 3 ATP par tour, en utilisant 10 (ou 12, 14?) protons par tour. Animations de Thomas M. Terry, The University of Connecticut Modèles de fonctionnement de l'ATP synthase Animation expliquant la photosynthèse |
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Biochimie de tous les jours:La mayonnaise comme exemple pratique de biochimie m'a été inspirée par le livre d'Hervé This, "Les secrets de la casserolle"). |
World Index of BioMolecular Tutorials in Chime |
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Programme de visualisation en 3-D de molécules Protéine Explorer (anglais). Je n'ai pas pu charger de structures du réseau dans la version française Vous devez avoir installé le plugin gratuit MDL Chime pour utiliser ce programme. Vous devez aussi autoriser les fenêtres pop-up. Protéines à voir (code pdb): Didacticiels de Carnegie Mellon U: Molecular Models for Biochemistry par exemple sur la protéine G (structure secondaire, amphipathie, ponts H), |
voir par ex. la GFP et les porines
Propriétés et images des acides aminés et des macromolécules (IMB Jena) |
Myoglobines (Mb) et hémoglobines (Hb) (code pdb)
Mb oxy (1ltw), désoxy (1mbd), liée au CO (1mcy) |
chymotrypsine (Wellesley), Didacticiels Chime de l'UMass (Amherst), dont Anticorps, MHC, DNA, etc Didacticiels de Kenyon College, créés par des étudiants, dont entre autres hémagglutinine du virus de la grippe, porines, tRNA synthétase, catalase, fibronectine. |
Vous pouvez trouver pratiquement toutes les structures connues au site Molecules R US Prédictions de structures secondaires : BCM Search Launcher, ExPaSy Proteomics Tools Molecular Graphics Manifesto: Why and How to Integrate Molecular Graphics into Introductory Biochemistry AutoDock (automated docking of flexible ligands to macromolecules) |
" Animations avec Protein explorer, Banque d'animations de protéines (molmovdb), animations d'aquaporines, Visual Molecular Dynamics Des animations qui montrent la nature dynamique des protéines, par ex. HDL, le dépliement de la titine, l'interaction biotine-avidine, etc. DSMM - Database of Simulated Molecular Motions |
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Actuel: La grippe humaine et la grippe aviaireQu'est-ce que la grippe GS4104 (Tamiflu®): forme utilisable oralement de la substance active, GS4071 |
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le charbon (anthrax)Voir sur le site Protéines à la Une la page sur la toxine de l'anthrax |
Comment développer rationnellement un médicament: Rational basis of drug design avec exemples d'antibiotiques, inhibiteurs de protéase HIV, sildenafil |
Liens pour médecins:MedicalWord Search |
la vache folle (BSE)L' ESB en Suisse |
Le sildenafil citrate (Viagra®) est un analogue du cGMP et en conséquence un inhibiteur compétitif de la phosphodiesterase type 5 spécifique du cGMP (PDE5). Il augmente l'effet du signal transmis par le NO dans les corps caverneux du pénis et renforce l'érection. Sélectivité: plus efficace sur PDE5 que sur PDE6 (10x), PDE1 (>80x), PDE2, PDE3, et PDE4 (>1000x). PDE6 est impliquée dans la vision des couleurs, PDE3 dans la contraction cardiaque, ce qui explique certains effets secondaires. |
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Le finasteride (Propecia®) est un inhibiteur irréversible de la 5-a-reductase qui transforme la testostérone en dihydrotestostérone à l'aide du cofacteur NADPH. La dihydrotestostérone est impliquée dans la perte des cheveux chez les hommes. | L'inhibiteur de la lipase pancréatique, Orlistat (Xenical®), est dérivé de la substance bactérienne lipstatine. Il empêche la digestion des graisses. C'est un inactivateur covalent ou substrat-suicide (C50 = 0.14 µM) |
Voir aussi la structure de la cyclooxygénase et le mode d'action des anti-inflammatoires non-stéroïdiens sur Interactive biochemistry (suivre le lien "studying protein structures" du menu principal) |
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Cours/Tutorial de Biologie Cellulaire (Mark Dalton, U of Minnesota)
Cours du MIT (hypertextbook), chapitre sur la biologie cellulaire Films montrant la formation de vésicule à manteau de clathrine Explications de méthodes d'amélioration d'images de microscopie Molecular expressions (galerie photo de microscopie)
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Cours de biochimie CAT de l'université La Trobe, Australie |
Cellular organelles Cellule virtuelle |
Cell Biology topics (The University of Texas Medical Branch) |
Cell Signalling pathways
AfCS-Nature Signaling Gateway |
Gerdes Group Heidelberg |
Yale University, Dept of Cell Biology, un centre de recherche sur le traffic intracellulaire: Pietro De Camilli, Susan Ferro-Novick, James D. Jamieson, Ira S. Mellman, Peter J. Novick, Graham Warren, etc |
Accès à quelques livres complets online, en particulier Molecular Biology of the Cell (Alberts et al., 1994) Molecular Cell Biology (Lodish et al., 1999) Modern Genetic Analysis (Griffiths et al., 1999), C.elegans II (Riddle et al., 1997) |
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BioimageCollection d'animations : par ex. du Visible Human Project, des structures cellulaires Collection d'images: par ex. des structures cellulaires, des protéines, des acides nucléiques, des bactéries, des champignons, des parasites,
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Dictionnary of Cell Biology | CSU Bioweb - Cell Biology BIOSCIENCES |
Cell & Molecular Biology - Frequently asked questions |
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Biologie moléculaire |
Pea Soup: the story of Mendel MendelWeb: un site sur la génétique Versuche über Pflanzen-Hybriden (1865) von Gregor Mendel. Complete works of Charles Darwin, Sean B. Carroll (Making of the Fittest), |
Cell and Molecular Biology online
Glossary of Biochemistry |
Guides, cours et documents Liste maintenue par l'Institut Pasteur, qui offre un service de recherche de documents Bio_Netbook |
Un tutorial sur la Structure de l'ADN (nécessite Chime)
Beginners Guide to Molecular Biology Tutoriels de Kenyon College, créés par des étudiants, dont entre autres répresseur lac, protéine CAP (catabolite activator protein), polymérase, transposase, réplicase, recombinase Effet de différent types de mutation sur l'hémoglobine (missense, non-sense, frameshift) |
What The Heck is PCR ? Présentation graphique de la PCR DNA Learning Center du Cold Spring Harbor Laboratory Des exercices pour contrôler votre compréhension des concepts de biologie moléculaire Alan Christensen's Courses on biotechnology and genetic engineering |
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Une animation montrant la déformation de l'ADN par le répresseur lac Graphics Gallery : Diagrammes explicatifs pour la biologie moléculaire, la biochimie, la biologie cellulaire, la génétique, etc. |
Structure d'ADN formes B et Z Facteurs de transcription Facteur TATA-binding (TBP) |
Transmission de signaux intracellulaires:
Voir les cartes de voies de transmission de signaux |
Recettes pour préparer de l'ADN de blé ou de tomate dans votre cuisine! | Cartoons | Génome humain
Numéro spécial de Nature et de Science ENSEMBL, un site sur l'interprétation des séquences, cartes, etc. |
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Bibliothèques de l'Université de Neuchâtel
Consortium des bibliothèques universitaires suisses |
High Wire Press: liste de journaux à accès libre (avec délai) US National Library of Medicine NLM |
Liste d'universités dans le monde, sur le site du MIT Engin de recherche de sites WWW: Virtual Tourist |
Recherche en Biosécurité et Evaluation des conséquences du progrès technique (BATS Information Biotechnologie Suisse (Bioweb). Le Bioweb est un service des agences BICS et BATS du Fonds National Suisse. Forum Recherche Génétique et Forum Biodiversité de l'ASSN |
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